به گزارش پرتال امام خمینی(س)؛ متن پیام آیت الله سید حسن خمینی بدین شرح است:
بسمه تعالی
إذا مات العالم ثُلم فی الإسلام ثَلمة لا یسدّها شیء
درگذشت عالم مجاهد و ارزشمند حضرت آیت الله سید یحیی جعفری طاب ثراه موجب تأثر آشنایان و علاقمندان به ایشان شد. خدای متعال ایشان را که در طول عمر با برکت خود منشأ خدمات بسیار و کانون التفات مردم استان کرمان بودند، در جوار رحمت واسعه خویش مشمول لطف و کرامت خود گرداند.
اینجانب ضمن آرزوی علو درجات برای آن فقید سعید،این ضایعه را خدمت خانواده ایشان و مردم شریف استان کرمان تسلیت عرض می نمایم.
سید حسن خمینی