19 اسفند 1363 ش (17 جمادی‌الثانی 1405 ق) تأکید امام خمینی بر استقلال و عدم وابستگی وزارت اطلاعات به احزاب حضرت امام خمینی(س) در ملاقات با آقای ری‌شهری وزیر اطلاعات، معاونان، مدیران و سرپرستان کل این وزارتخانه سخنان بسیار ارزنده‌ای در مورد وزارت اطلاعات مطرح کردند. در این سخنرانی به اهمیت جایگاه وزارت اطلاعات و کار اطلاعاتی، حاضر و ناظر دیدن خدا در امور، اصل استقلال و عدم وابستگی حزبی و گروهی در وزارت اطلاعات، خطر دخالت اغراض و گرایشها در این امر برای خود فرد و نیز مردم، ضرورت مستقل، متقی و منزه بودن کارکنان این وزارتخانه، پرهیز از تندروی و تنداندیشی و رسیدگی سریع به وضع زندانیان امنیتی اطلاعاتی و دقت لازم در این امر، پرداخته شده است:
«تمام کسانى که در این وزارتخانه هستند باید در هیچ گروه و حزبى نباشند. وابستگى به گروهها، وابستگى فکرى و عملى مىآورد و این با کار شما منافات دارد. باید همه شما بیطرفِ بیطرف باشید؛ دشمنى، دوستى، آشنایى و غریبى در کار نباشد. این کار خطرش بسیار است، آن طرف هم چون اسلام است اجرش زیاد است. باید فکر کنید که اگر امروز مطلبى را مخفى کردید، فردا چه مىکنید. عالم- چه براى آن که عالم را مىخورد و چه براى درویش- مىگذرد، باید به فکر فردا بود. مبادا کسى پیدا شود و از روى اغراض و گرایشها عمل کند که این کار هم براى خودش خطرناک است و هم براى مردم. در مرحله اول، خطر براى خود انسان دارد، ولى انسان غافل است. داخل شدن در گروهى طبعاً یک نوع گرایش به آن گروه به وجود مىآورد که با کارهایى که شما مىخواهید انجام دهید، منافات دارد. باید افراد اطلاعات مستقل، منزه و متقى باشند. من امیدوارم که شما همین طور باشید و دوستانتان را موعظه کنید که مبادا تندروى کنند. مبادا به خاطر تنداندیشى، یک بیچاره اى بی‌جهت گرفتار شود».صحیفه امام؛ج۱۹؛ص۱۷۹